本实验室集产品开发、技术研究、人才培养与技术交流于一体，重点解决菌种筛选、发酵工程、分离纯化、微生物检测等重大关键性、前沿性和共性技术问题。中心实验室建有生物技术实验室、发酵实验室、分离纯化实验室、冻干实验室、检测实验室、菌种保藏中心，涵盖生物医药、生物制造、生物农业等领域。